专用基金不应缴纳所得税，其他类型的缴纳应缴纳所得税。
拆迁补偿费不缴纳所得税。这是地方政府或拆迁部门的一项法规，做法并非在所有地区都是一致的，但法律并未对此加以规定。
根据《中华人民共和国企业所得税法》（中华人民共和国总统第63号法令）：企业在每个纳税年度的总收入，扣除非应纳税所得额，自由收入，各种扣除额，并计入前几年的补偿金损失后的余额为应纳税所得额。此外，根据国家税务总局关于印发《企业搬迁所得税管理办法》的公告（国家税务总局公告2012年第40号）扣除搬迁费用后的搬迁收入余额是企业的搬迁收入。企业应在搬迁完成当年计算应纳税所得额，并将搬迁收入计入企业应纳税所得额。
企业政策迁移是指出于公共利益的需要，在政府领导下的企业整体迁移或部分迁移。如果企业由于下列需求之一提供相关的书面证据，则是政策重定位：
（1）国防和外交的需求；
（2）政府组织实施的基础设施需求，例如能源，交通和水利设施；
（3）政府实施的科学，技术，教育，文化，卫生，体育，环境和资源保护，防灾减灾，文物保护，社会福利和市政事业等公共事业的需求;
（4）政府实施的经济适用房项目建设需求；
（5）政府必须按照《中华人民共和国城乡规划法》的有关规定，对危险的建筑物和落后的基础设施进行集中改造；
（6）法律和行政法规规定的其他公共利益的需求。
因此，贵公司应先按照40号公告的规定检查其搬迁行为是否为政策搬迁。如果符合政策搬迁，则可以按照40号公告的规定进行讨论。收入，搬迁支出，搬迁资产的税收处理，搬迁收入和其他所得税的征收管理事项，分别进行税收管理和核算，在搬迁完成年度，将搬迁收入计入企业应纳税所得额进行纳税计算；如果不符合政策搬迁收入，应当在取得搬迁收入的当年将其收入纳入全部收入，计算所得税。