合理避免员工工资的税收，目前常用的方法如下：
（一）在扣除应纳税额之前，尽量安排工资分配；
（二）改善职工福利，减少名义收入；
（3）可以采用延期或提前的方法来大致平均月薪收入；
（4）纳税人在尽可能长的时间内分期领取劳动报酬。
其中：改善员工福利和减少名义收入的方法有：
（一）企业提供住所是合理避免个人所得税避税的有效方法；
（二）企业提供度假旅行津贴；
（三）向保险公司购买理财保险；
（4）其中一部分包含在工资单中，其余的工资通过发票偿还；
（五）争取税务部门的更多利益，争取更多利益；
（六）实物分配；
（7）多付公积金（但同一家公司也面临多付，好像重庆的出资比例是确定的）
（8）公司提供员工福利设施。如：
①公司免费提供午餐，或公司直接支付合作伙伴管理费；
②企业提供并安排免费医疗补助；
③使用企业提供的住宅设备；
④企业提供运输；
⑤企业设立职工子女教育基金，为职工子女提供奖学金等。
1.公司可以将这些发票用作公司支出，实际上，公司自己为自己逃税。 （非法行为）
2.关于“工资发票”，许多企业表示“为了合理避免对雇员征税”。从表面上看，员工和单位都是有利可图的。但是实际上，眼前的利益确实属于员工，从长远来看，它将损害员工。
例如，对于雇员而言，损害是养老保险，医疗保险，住房公积金，工伤保险等，因为雇员的社会保险，公积金和其他社会福利是根据公司的账面工资计算的。减少这些账面工资之后，员工的社会福利也随之减少，结果直接影响了员工的各种社会保障福利。
扩展信息
发票在中国的社会经济活动中具有极其重要的意义和作用。
1.发票具有合法性，真实性，统一性和及时性的特点，是最基本的原始会计凭证之一；
2.发票是记录经济活动内容的载体，也是财务管理的重要工具；
3.发票是税务机关控制税源和征税的重要依据；
4.发票是国家监督经济活动，维护经济秩序，保护国家财产安全的重要手段。
参考文献
百度百科-发票
主要原因是合理的避税需要单位能量和物质资源。
合理避税是指在遵守税法，依法纳税的前提下，纳税人采取适当的措施避免纳税义务，减少税收支出。 合理避税不是逃税或逃税。 这是正常的法律活动。
中华人民共和国税收征管法
第六十一条代扣代缴代理人未设立，代扣代缴税款，代收代扣代缴税款，或者代扣代扣代缴税款和有关会计凭证及有关资料不备的，征税机构责令限期改正，可以 处以最高2000元罚款； 情节严重的，处以2000元以上5000元以下的罚款。