企业营业税:按照开票额的5%%
企业所得税:按照利润总额的25%%缴纳
增值税按照17%%（如果有的话）
具体需要和税务专管员协商。比如我们在没有盈利的情况下，企业所得税需要按照开票额*10%%*25%%
和我们公司的情况差不多，一样都是代理服务业。
开出去的发票，包含代收代付部分的关税、进口费用等
借：银行存款/应收账款/预收账款/现金
其他应收款-某某公司
贷：主营业务收入
应交税金-应交增值税（销项税额）
其他应付款（此外开出去的发票中有代收代付的部分）
和原来一样，收到理货费等费用，入成本。
借：主营业务成本
贷：应付账款/银行存款/应付票据/预付账款等科目
就是借：应收账款 贷：主营业务收入就行 增值税申报的时候填到 免税货物及劳务销售额
〈国税发[1995]76号〉、财税[2003]16号、国税函〔2007〕908号 以及当地的相关规定：
一、对从事代理运输业务的单位和个人，以其向货主或旅客收取的全部价款和价外费用扣除支付承运方的运费及其他相关费用后的余额为营业额。"其他相关费用"包括报关费、商检费、仓储费等费用。
二、根据(财税 [2003]16号），营业额减除项目支付款项发生在境内的，该减除项目支付款项凭证必须是发票或合法有效凭证；支付给境外的，该减除项目支付款项凭证必须是外汇付汇凭证、外方公司的签收单据或出具的公证证明。凡以应税收入扣减若干减除项目金额后的余额为应纳税营业额的纳税人，必须将符合财税[2003] 16号文中第四点所规定的支付款项凭证记录的金额，单列登记在成本、费用帐簿中，申报纳税时以当期核算的有关减除项目发生额作为“营业额减除项目”。
三、国税函〔2007〕908号《国家税务总局关于代理业营业税计税依据确定问题的批复》，
纳税人从事代理业务，应以其向委托人收取的全部价款和价外费用减除现行税收政策规定的可扣除部分后的余额为计税营业额。
纳税人从事代理业务，应凭以下凭证作为差额征收营业税的扣除凭证：营业额减除项目发生在境内的，该减除项目支付款项凭证必须是发票或其他合法有效凭证；
支付给境外的，该减除项目支付款项凭证必须是外汇付汇凭证、外方公司的签收单据或出具的公证证明。
1.财务核算：没有什么特别科目，可以使用通用科目。
具体科目运用及核算，这里无法一一表述。
2.税收方面： 货代公司有相关税收优惠，营业收入可以扣除相关成本及费用后，按照其净额交纳营业税。
营业税：5%%
城建税：营业税7%%，
教育费附加：营业税4%%
企业所得税：核定还是查帐？
财务的工作不是很多，但是比较繁琐，而且里面有很多东西都是财务去和银行打交道，例如汇票、信用证等等，货代行业的会计不只是单一的去做一些账目，所以，如果你想进入的话最好能去先学习一下专业的知识，有一个国际货运代理从业资格证的考前培训，学习的知识比较系统，而且也很全面，全国很多地方都有这个，你可以去了解一下，最好的话也去考一个国际货运代理从业人员资格证，因为掏钱培训了，考试才要200块，直接考了得了，要是过了还得个证书，而且这个行业也在不断的完善中，估计现在不考以后发展成类似于教师资格证，会计从业证 的时候，再考就难了。
对于单个内资企业是不能避税的,只有......
因为流转税是没有优惠政策,只能在所得税上面
1.运输业最大一块成本是路桥费和油费,这些东西是没有办法定量核算的,所以在一定程度上可以控制做,有很多个体司机他们有大量这种票,他们留着没有用,可以让自己司机找他们要一点
2.运输费的发票运输业是可以抵扣的,在你们转包给别人的业务尽可能让他们开票,直接冲减收入,这一块营业税抵减了,成本也有了.
上面第二条是合法的,转包签转包协议,自己打的协议都可以