在此阶段，以下四个因素导致中小企业进行税收筹划的风险。
1.不稳定的税收筹划基础造成的风险
中小企业需要良好的税收筹划基本条件。税收筹划的基础是指企业管理决策水平和相关人员对税收筹划的理解，企业会计和财务管理水平以及与税收有关的企业的完整性的基本条件。如果中小企业的管理决策水平不了解，关注甚至认为税收筹划是为了建立关系，寻找方法，寻找出路而少付税款；企业也有逃税的历史，或者有很多违反税法的记录等，导致税收筹划基础非常不稳定。在此基础上进行税收筹划极具风险。这是中小企业在税收筹划中最重要的风险。
2.税收政策变更带来的风险。
税收政策变更是指国家税收法规限制的不确定性。随着市场经济的发展和变化以及国家产业政策和经济结构的调整，必须始终相应地改变税收政策，以适应国民经济的发展。因此，国家税收政策是不规范的或相对短期的。税收筹划是预先计划。每个税收筹划都需要一个从最初的项目选择到最终成功的过程。在此期间，如果税收政策发生变化，则可以根据原始税收政策制定税收筹划计划。从法律方案变为非法方案，或从合理方案变为不合理方案，都会导致税收筹划的风险。
3.税收行政执法不当造成的风险。
税收筹划和避税之间的本质区别在于，这是合法的，符合立法者的意图，但实际上，这种合法性需要得到税收行政执法部门的确认。在确认过程中，客观上存在因税收行政执法不当而导致税收筹划失败的风险。因为无论采用哪种税收，税法都在税收范围之内，因此具有一定的灵活性。只要税法没有规定行为，税务机关有权根据自己的判断确定是否为应税行为。由于质量参差不齐等因素，税收政策实施中出现偏差的可能性是客观的，其结果是企业合法的税收筹划行为可能导致税收筹划方案成为空白文件，或者由于税收征管中的偏差而被认为是恶意的。执法。避税或逃税的税收处罚；或暂时保留明显违反税法的公司税收筹划行为，使企业对税收筹划有一种幻想，并为将来更大的税收筹划风险造成隐患。
4.因税收筹划目的不明确而引起的风险。
税收筹划活动是公司财务管理活动的组成部分。最大化税后利润只是税收筹划的分阶段目标，而最大化纳税人的公司价值是其最终目标。因此，税收筹划应服务于公司财务管理的目标，并服务于公司战略管理目标的实现。如果企业税收筹划方法不符合生产经营的客观要求，而过多的减税减免效果破坏了企业的正常财务管理秩序，将导致企业内部运行机制的混乱，并最终导致给企业带来更大的潜在损失发生风险。税收筹划成本包括显性成本和隐性成本，其中显性成本是指执行税收筹划所产生的所有实际成本。在税收筹划计划中已经考虑了它。隐含成本是机会成本，是指纳税人由于采用建议的税收筹划计划而放弃的收益。例如，由于采用税收优惠计划而导致企业的资本占用增加。资本占用的增加实质上是投资机会的损失。这是机会成本。在税收筹划的实践中，企业通常会忽略这种机会成本，从而导致计划结果和计划成本不成功的风险。
税收筹划的目的是使企业价值最大化。这是一种方法和手段，而不是企业的最终目的。在这一点上，目前尚不清楚，可能会做出错误的决定。减少所得税和浪费，大大增加不必要的支出；为了推迟获利年度，以调整“两免三减”免税期的到来，忽略生产和经营，造成连续亏损等。这种将马车放在马前的做法对公司一种好处将不可避免地导致企业整体利益的损失，这将导致整体税收筹划失败。
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