用外行的话来说，税收筹划的风险是税收筹划活动由于各种原因而失败的代价。因为税收筹划是在经济行为发生之前做出的决定，并且税收法规具有时效性，再加上操作环境因素和其他因素的复杂性，使其变得不确定并隐含着更大的风险。因此，企业在进行税收筹划时应充分考虑风险因素。
1.政策风险。税收筹划利用国家政策的风险来节省税收，这称为政策风险。政策风险包括政策选择风险和政策变更风险。政策选择风险是指政策选择是否正确的不确定性。这种风险主要是由于计划者对政策精神的理解不足，不完全理解和不正确理解所致。也就是说，计划者认为所采取的行动符合国家政策的精神，但实际上不符合国家的法律法规。例如，一家服装厂接受自雇购买的纽扣，但是由于未按要求完成购买程序，因此税务机关在税务检查中确认接受了第三方发票。不仅扣除了扣除额，还相应地受到了惩罚。政策变更的风险是指政策及时性的不确定性。为了适应市场经济的发展，反映国家的产业政策，及时调整经济结构，不能确定国家的税收政策。随着经济形势的发展，总是有必要做出相应的改变。二，及时对法律法规进行补充，修订或完善，继续废除旧政策，适时出台新法规。从这个意义上讲，政府的税收政策总是不规则的或相对短期的。例如，从1998年1月到1999年12月，为了抵御席卷1997年的东南亚金融危机的影响并刺激了外贸出口，国家税务总局已经六次调整了出口退税政策，并且全国平均综合退税率有所提高。从1999年到2001年的三年中，为适应市场经济发展和各种国内外经贸形势的发展要求，中国出口退税政策发生了11次变化；根据《金融时报》，它有利于中央和地方政府重新分配税收，减轻政府的财政负担，减轻人民币对市场升值的压力，并逐渐减弱中国在亚洲金融危机后对中国出口退税增加的影响。 1998。开始将出口退税率从目前的平均15％降低到11％；同时，羊毛，铅，焦炭，稀土，钨的出口退税将首先取消； 2010年前后，出口退税政策将彻底取消。从实践上看，一旦实施这一政策，那些依靠出口退税的企业将面临厄运，甚至有些灾难性。因此，政策的不规范或及时性将给企业的税收筹划（尤其是中长期税收筹划）带来更大的风险。
2.操作风险。因为税收筹划的固有特征是与“法律”共舞，也就是说，税收筹划通常在税收法规的边缘进行操作，以帮助纳税人最大化其利益。另外，中国的税收立法体系水平高，立法水平不高。法规的内容不仅含糊不清，而且法规之间也存在一些冲突或磨擦，甚至专业人员有时也难以准确地掌握它们，这给纳税人的税收筹划带来了巨大的操作风险。从实践的角度来看，操作风险包括两个方面：第一是应用和实施相关税收优惠政策的风险。例如，由于残疾人比例不足，他们从福利企业中受益，并且由于可再生资源利用不足，享受与环境保护有关的税收优惠。其次，在系统的税收筹划过程中，税收政策的整体完整性未得到充分把握；在企业重组，合并，分立过程中，多种税收优惠措施的运作等税收筹划风险的综合利用。根据有关规定，一般而言，合并后的企业应当从资产转让中计算收入，并依法纳税。被合并企业前一年的亏损，不应当结转为被合并企业，由被合并企业向被合并企业承担费用的，或者在股东的购买价格中，现金，有价证券及合并后企业权益以外的其他资产，不高于实缴股本票面价值（或实缴股本账面价值）的20％。 。合并后的企业可能不会确认所有资产转让的收入或损失，也不会计算所得税。合并前的全部企业所得税事项，由合并企业承担。上一年的亏损未超过法定弥补期间的，合并后的企业可以继续按照规定使用。合并企业在以后年度实现与资产相关的收入补偿。如果没有系统地理解所有这些，并没有以一种综合的方式对其进行全面地理解和使用，那么它们很容易相互忽视，从而导致税收筹划失败的风险。